地球航天基地捕捉到一組神秘的信號，科學家認為信號來自宇宙其他的文明。

為探尋外星文明，艦長“原”駕駛著星際飛船——深空號，帶領全船93名船員和智能機器人“柒”駛向宇宙，踏上星辰征途。但不久后，飛船神秘失蹤。

150年后，深空號飛船突然出現在地球軌道附近，船上只剩下一名幸存的休眠者， 她是艦長原的戀人“尹”。

人類航天部門成立臨時委員會，對尹進行調查和詢問，“深空號”的驚悚經歷徐徐展開。